Рестрикционный фермент EcoRI разрезает ДНК по последовательности ГААТТЦ. Насколько часто этот фермент будет разрезать двухцепочечную ДНК?
Рестрикционный фермент EcoRI распознает и разрезает ДНК по последовательности GAATTC. Эта последовательность состоит из 6 нуклеотидных пар.
Частота разрезания двухцепочечной ДНК рестрикционным ферментом EcoRI будет зависеть от количества встречаемых последовательностей GAATTC в геноме.
В геноме человека, гаплоидный геном содержит около 3×10^9 нуклеотидных пар ДНК. Для определения количества встречаемых последовательностей GAATTC, мы должны знать вероятность встречи этой последовательности в случайной последовательности ДНК.
Последовательность GAATTC имеет длину 6 нуклеотидных пар. Вероятность встретить эту последовательность в случайной последовательности ДНК составляет (1/4)^6 = 1/4096.
Таким образом, ожидается, что в гаплоидном геноме человека фермент EcoRI будет разрезать двухцепочечную ДНК примерно (3×10^9) / 4096 = 732,422 раз.