Каким образом осуществляет разрезание фермент рестрикции EcoRI?

Фермент рестрикции EcoRI привязывается к двуцепочечной ДНК и распознает специфическую палиндромную последовательность GAATTC. После распознавания EcoRI производит разрез обеих цепей ДНК между G и A нуклеотидами в каждой цепи. Разрезание происходит по следующему механизму:

1. Распознавание целевой последовательности: EcoRI ищет и связывается с палиндромной последовательностью GAATTC на двуцепочечной ДНК.

2. Образование комплекса: После связывания с целевой последовательностью, EcoRI образует комплекс с ДНК, при этом активный сайт фермента выравнивает и разделяет цепь ДНК.

3. Разрезание ДНК: Эндонуклеазная активность EcoRI позволяет ферменту разрезать каждую цепь ДНК между G и A нуклеотидами, образуя «липучие» концы.

4. Образование разрезанных фрагментов: В результате действия EcoRI образуются два фрагмента двуцепочечной ДНК с «липучими» концами, которые могут быть использованы для клонирования или других молекулярно-биологических процедур.

Таким образом, EcoRI осуществляет разрезание ДНК путем распознавания специфической последовательности и разрезания обеих цепей ДНК в определенных местах, что делает его ценным инструментом в генетических исследованиях и биотехнологии.